Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b2Q3UJB0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms