Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrc58Q3UGP9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrc58Q3UGP9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms