Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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Gtpbp6Q3U6U5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Aebp2-205ENSMUST00000160836 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Gtpbp6Q3U6U5 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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