Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q3U595 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q3U595 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q3U595 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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