Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud5Q3U2S4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms