Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KhsrpQ3U0V1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KhsrpQ3U0V1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KhsrpQ3U0V1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KhsrpQ3U0V1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KhsrpQ3U0V1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KhsrpQ3U0V1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KhsrpQ3U0V1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KhsrpQ3U0V1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms