Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Tbc1d2bQ3U0J8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms