Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lrrc28Q3TX51 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lrrc28Q3TX51 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lrrc28Q3TX51 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lrrc28Q3TX51 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lrrc28Q3TX51 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lrrc28Q3TX51 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrrc28Q3TX51 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrrc28Q3TX51 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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