Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms