Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gdpgp1Q3TLS3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms