Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms