Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sppl2bQ3TD49 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sppl2bQ3TD49 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms