Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RubcnlQ3TD16 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms