Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms