Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Shroom4Q1W617 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Shroom4Q1W617 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Shroom4Q1W617 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Shroom4Q1W617 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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Shroom4Q1W617 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms