Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmprss11cQ1JRP2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms