Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ptcd3Q14C51 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms