Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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