Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Traf3ip1Q149C2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Traf3ip1Q149C2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Traf3ip1Q149C2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Traf3ip1Q149C2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Traf3ip1Q149C2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms