Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms