Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms