Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisal1Q0VBP7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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