Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
StumQ0VBF8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms