Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms