Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrioQ0KL02 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms