Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gdf3Q07104 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gdf3Q07104 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gdf3Q07104 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gdf3Q07104 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gdf3Q07104 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gdf3Q07104 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gdf3Q07104 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gdf3Q07104 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gdf3Q07104 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gdf3Q07104 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gdf3Q07104 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gdf3Q07104 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gdf3Q07104 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gdf3Q07104 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gdf3Q07104 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gdf3Q07104 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gdf3Q07104 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gdf3Q07104 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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