Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms