Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms