Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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