Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms