Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms