Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms