Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms