Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mc1rQ01727 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms