Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms