Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23aQ01405 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms