Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde1bQ01065 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms