Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms