Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

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Length 3,329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Brca2P97929 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Brca2P97929 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Brca2P97929 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Brca2P97929 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Brca2P97929 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Brca2P97929 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Brca2P97929 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Brca2P97929 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Brca2P97929 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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