Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlkP97793 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AlkP97793 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AlkP97793 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlkP97793 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlkP97793 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlkP97793 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlkP97793 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlkP97793 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlkP97793 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlkP97793 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlkP97793 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlkP97793 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AlkP97793 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlkP97793 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlkP97793 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlkP97793 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AlkP97793 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AlkP97793 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AlkP97793 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms