Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smyd1P97443 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Smyd1P97443 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smyd1P97443 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smyd1P97443 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smyd1P97443 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smyd1P97443 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smyd1P97443 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smyd1P97443 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smyd1P97443 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms