Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Nbr1P97432 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Nbr1P97432 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Nbr1P97432 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Nbr1P97432 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nbr1P97432 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Nbr1P97432 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Nbr1P97432 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Nbr1P97432 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Nbr1P97432 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Nbr1P97432 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Nbr1P97432 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Nbr1P97432 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms