Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmsP97355 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SmsP97355 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SmsP97355 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SmsP97355 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SmsP97355 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SmsP97355 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmsP97355 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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