Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms