Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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