Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms