Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54lP70270 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54lP70270 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54lP70270 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54lP70270 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54lP70270 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54lP70270 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54lP70270 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54lP70270 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54lP70270 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54lP70270 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54lP70270 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54lP70270 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54lP70270 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54lP70270 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms