Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pkn1P70268 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn1P70268 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms