Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms