Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms